Aquí tienes dos buenas opciones de antivirus de código abierto :
ClamAV
El motor de antivirus open source y gratuito ClamAV es muy completo en funcionalidades: escaneo del correo electrónico, escaneo web, actualizaciones automáticas de la base de datos de virus y escaneo de amenazas para todo tipo de archivos, incluyendo Office, HTML, Flash, PDF, Zip, RAR, Dmd. Tar, Gzip, Bzip2, OLE2, Cabinet, CHM, BinHex, SIS, etc. Es compatible con ficheros ejecutables -como UPX, FSG o wwpack32.
También detecta troyanos, virus y malware.
Clamwin
Uno de los antivirus de código libre más antiguos para Windows es Clamwin, que está basado en el motor de ClamAV. Permite programar escaneos, actualiza automáticamente las bases de datos de virus -también permite buscar virus específicos-, se integra con Microsoft Windows Explorer y Microsoft Outlook. Tiene un alto porcentaje de detección de virus y spyware.
No incluye búsqueda en tiempo real, debes analizar manualmente el fichero para detectar el virus o spyware.
Sí que dispone de una versión portátil que es bastante interesante porque lo puedes utilizar desde una memoria USB (sin instalación).